Algoritmus ukázal přenos genů mezi odlišnými druhy bakterií

Streptococcus pneumoniaeVědci z finské univerzity Aalto zkombinovali strojové učení a bioinformatiku, aby vytvořili nový počítačový algoritmus. Jeho úkolem je modelovat přenosy genů nejen mezi různými rodovými liniemi bakteriální populace, ale dokonce mezi různými druhy.

Bakterie si předávají genetický materiál v procesu nazvaném horizontální přenos genetické informace. Díky němu může být genom jedné bakterie kombinací genů od několika různých dárců.  V tomto případě použili vědci algoritmus k analýze sbírky 616 kompletních genomů bakterie Streptococcus pneumoniae, která je významným lidským patogenem. Způsobuje celou řadu typů pneumokokových infekcí, jako je pneumonie, zánět středního ucha, bakteriální meningitida a další.

Studie identifikovala několik jednotlivých genů, u kterých jsou genové přenosy obzvláště časté. Jsou mezi nimi i geny, které u bakterií způsobují rezistenci na antibiotika. „V případě genů pro rezistenci vůči antibiotikům, může počet přenosů genetických informací souviset s tím, jak jsou tyto geny pro bakterie užitečné, a s výsledným selekčním tlakem,“ říká výzkumný pracovník Pekka Marttinen z fakulty informatiky univerzity Aalto.

Vědci prokázali, že se přenos genetické informace objevuje, jak v rámci jednoho druhu, tak i mezi několika různými druhy. Velký počet přenosů zjištěných během studie byl přitom pro výzkumníky překvapením. „Předchozí studie ukázaly, že jsou přenosy genetické informace běžné u jednotlivých genů. Náš tým byl však první, který použil výpočetní metodu, aby ukázal rozsah přenosů napříč celým genomem,“ dodává Marttinen.

Publikováno:
Další články autora
Právě v prodeji
Tip redakce

Související články

Světově unikátní detektor elektronů pochází z Brna

Světově unikátní detektor...

Tým brněnských vědců vyvinul a patentoval unikátní detektor elektronů pro tzv....
Když vědci sledují život v buňkách

Když vědci sledují život v buňkách

Vědci ze specializovaného metabolomického pracoviště Biologického centra AV ČR v...
Původce černého kašle je mistrem v manipulaci s imunitou. Čeští vědci ukazují proč

Původce černého kašle je mistrem v...

Bakterie způsobující černý kašel, onemocnění dýchací soustavy s potenciálně...
Jak bude vypadat svět “zítra”?

Jak bude vypadat svět...

Odborníci z IBM každoročně přicházejí s technologickou předpovědí nazvanou “5...
Nemoc X: Velká neznámá, která může ohrozit lidstvo

Nemoc X: Velká neznámá, která...

Její nebezpečnosti by se mohla rovnat snad jen její neznámost....
Jak vzniká kostra rostlin?

Jak vzniká kostra rostlin?

Vliv proteinu katanin1 na organizaci rostlinného cytoskeletu, tedy...
Žraví drobečkové vyčistí vody od nečistot

Žraví drobečkové vyčistí vody od...

Heterotrofní bičíkovci – drobné prakticky bezbarvé jednobuněčné organismy o...
Výprava do středověkých Čech: Kingdom Come: Deliverance

Výprava do středověkých Čech:...

Je to už neuvěřitelných 16 let, co si český vývojářský tým Daniela Vávry...
Nové viry objevené v oceánu

Nové viry objevené v oceánu

Není tajemstvím, že existuje po celém světě nejen mnoho...
Australské klokany zabíjí hrůzná nemoc

Australské klokany zabíjí hrůzná...

Dosud neznámá choroba kosí na australském kontinentě miliony klokanů....

Nenechte si ujít další zajímavé články

V Amazonii byl objeven nový druh vosy s obřím žihadlem

V Amazonii byl objeven nový druh...

Planeta Země nás nejspíše nikdy nepřestane udivovat. Stejně jako se jí...
VIDEO: Jak by vypadal svět bez plastů?

VIDEO: Jak by vypadal svět bez...

V poslední době slýcháme velmi často informace o tom, jak...
První světová válka zuřila i na africkém jezeře!

První světová válka zuřila i na...

Desítky mužů se lopotí v africké savaně. Vedro je k zalknutí. Po vodě ani...
Může nadměrný hluk útočit až na srdce?

Může nadměrný hluk útočit až na...

Bydlení u rušné komunikace, u letiště či třeba u hlučné továrny se směnným...
3 nejslavnější toreadoři: Sklání se před nimi býci i diktátor

3 nejslavnější toreadoři: Sklání se...

Francisco Goya se opět chápe štětce. Muž, který mu sedí modelem, se ani nepohne....
Sigourney Weaverová: Její Ripleyová zůstává nejslavnější akční hrdinkou!

Sigourney Weaverová: Její Ripleyová...

Nejvýznamnější akční hrdinka v dějinách filmu, a také jedna z nejčastěji a...
VIDEO: Krmit žraloka holou rukou není dobrý nápad!

VIDEO: Krmit žraloka holou rukou...

Zdá se vám krmení žraloků jako šílený nápad? A co krmení žraloků holou...
Podvodná cizinka princezna Caraboo: Navštívila Napoleona I. Bonaparta ve vyhnanství?

Podvodná cizinka princezna Caraboo:...

Večer 3. dubna 1817. Na prahu ševcova domku v obci Almondsbury na...
Přehledně: Co jste dosud nevěděli o Tunisku?

Přehledně: Co jste dosud...

Tunisko, omývané vodami Středozemního moře, pro Evropana představuje...
Poznejte své IQ

Poznejte své IQ

V našem profesionálně sestaveném testu ihned zjistíte přesné výsledky a obdržíte certifikát.