Algoritmus ukázal přenos genů mezi odlišnými druhy bakterií

Streptococcus pneumoniaeVědci z finské univerzity Aalto zkombinovali strojové učení a bioinformatiku, aby vytvořili nový počítačový algoritmus. Jeho úkolem je modelovat přenosy genů nejen mezi různými rodovými liniemi bakteriální populace, ale dokonce mezi různými druhy.

Bakterie si předávají genetický materiál v procesu nazvaném horizontální přenos genetické informace. Díky němu může být genom jedné bakterie kombinací genů od několika různých dárců.  V tomto případě použili vědci algoritmus k analýze sbírky 616 kompletních genomů bakterie Streptococcus pneumoniae, která je významným lidským patogenem. Způsobuje celou řadu typů pneumokokových infekcí, jako je pneumonie, zánět středního ucha, bakteriální meningitida a další.

Studie identifikovala několik jednotlivých genů, u kterých jsou genové přenosy obzvláště časté. Jsou mezi nimi i geny, které u bakterií způsobují rezistenci na antibiotika. „V případě genů pro rezistenci vůči antibiotikům, může počet přenosů genetických informací souviset s tím, jak jsou tyto geny pro bakterie užitečné, a s výsledným selekčním tlakem,“ říká výzkumný pracovník Pekka Marttinen z fakulty informatiky univerzity Aalto.

Vědci prokázali, že se přenos genetické informace objevuje, jak v rámci jednoho druhu, tak i mezi několika různými druhy. Velký počet přenosů zjištěných během studie byl přitom pro výzkumníky překvapením. „Předchozí studie ukázaly, že jsou přenosy genetické informace běžné u jednotlivých genů. Náš tým byl však první, který použil výpočetní metodu, aby ukázal rozsah přenosů napříč celým genomem,“ dodává Marttinen.

Publikováno:
Další články autora
Právě v prodeji
Tip redakce

Související články

Rubikova kostka, která pomáhá při rehabilitaci

Rubikova kostka, která pomáhá...

Vypadá jako „rubikovka“ moderního věku, ve skutečnosti ale klame...
Světová zdravotnická organizace varuje před nadměrným hraním her

Světová zdravotnická organizace...

Třetina českých dětí do 15 let, které se zapojily do průzkumu, tráví svůj volný...
ČVUT řeší, jak pomoci záchranářům

ČVUT řeší, jak pomoci záchranářům

Odborníci z Fakulty elektrotechnické ČVUT v Praze vyvinuli simulátor, který změní způsob...
Základy kvantového internetu položili čeští vědci

Základy kvantového internetu...

Budoucnost kvantového internetu je opět o krok blíže. Vědci z Univerzity...
Praha chce největší světové talenty na umělou inteligenci

Praha chce největší světové...

Oblast umělé inteligence (AI) by měl podpořit projekt prg.ai, ten si dal za...
Jaký je nejvýkonnější počítač v České republice?

Jaký je nejvýkonnější počítač v...

Fakulta elektrotechnická a Fakulta informačních technologií ČVUT v Praze...
Zjednodušte si život s moderními technologiemi

Zjednodušte si život s moderními...

Virtuální a rozšířená realita, autonomní řízení, celé zástupy chytrých čidel a...
Kdo bude slídilem roku? Nejvíce nominací získal Facebook

Kdo bude slídilem roku? Nejvíce...

Z 34 návrhů na slídila za loňský rok patřily hned 3 populární sociální...
Kdo nás nejvíce ozařuje?

Kdo nás nejvíce ozařuje?

Tak jako každý rok i nyní spatřily světlo světa výsledky měření radiace, vycházející z...
Byl spuštěn největší neuromorfní počítač na světě

Byl spuštěn největší neuromorfní...

Současným počítačům stále chybí rychlost. Nezvládnou fungovat jako...

Nenechte si ujít další zajímavé články

Lipník nad Bečvou překvapí

Lipník nad Bečvou překvapí

Asi 10 kilometrů východně od Olomouce nalezneme malebné městečko Lipník nad...
Kostel sv. Josefa při kapucínském klášteře ve Fulneku

Kostel sv. Josefa při kapucínském...

V severomoravském Fulneku (20 kilometrů jihozápadně od Ostravy) najdeme...
Cyklovýlet: Projížďka Českou Kanadou

Cyklovýlet: Projížďka Českou...

Tento výlet nás zavede do oblasti Třeboňské pánve, kraje rybníků a...
Bojiště budoucnosti: Když válčí roboti a zobou se zázračné pilule

Bojiště budoucnosti: Když válčí...

Helma, která snímá tep, a do žil pumpuje koňskou sílu, robotická pomoc, jakmile tělo...
Procházka v korunách lipenských stromů stromů

Procházka v korunách lipenských...

Stezka korunami stromů je celorepublikový unikát a vůbec první stezka...
Dechberoucí zámek Kratochvíle

Dechberoucí zámek Kratochvíle

Severozápadně od Českých Budějovic se poblíž městečka Netolice nachází...
Nejlepší německé zábavní parky

Nejlepší německé zábavní parky

Francie má svůj Eurodisneyland, Vídeň Prátr, ale víte, kde zábavní...
Itálie, země plná skvostů

Itálie, země plná skvostů

Když českou kotlinu ještě pokrývaly lesy, v Itálii už se stavěly...
Šumavský discgolf: adrenalinová zábava pro celou rodinu

Šumavský discgolf: adrenalinová...

Spojením golfu a frisbee vznikla zábava pro malé i velké, zkrátka u discgolfu se...
Poznejte své IQ

Poznejte své IQ

V našem profesionálně sestaveném testu ihned zjistíte přesné výsledky a obdržíte certifikát.