Algoritmus ukázal přenos genů mezi odlišnými druhy bakterií

Streptococcus pneumoniaeVědci z finské univerzity Aalto zkombinovali strojové učení a bioinformatiku, aby vytvořili nový počítačový algoritmus. Jeho úkolem je modelovat přenosy genů nejen mezi různými rodovými liniemi bakteriální populace, ale dokonce mezi různými druhy.

Bakterie si předávají genetický materiál v procesu nazvaném horizontální přenos genetické informace. Díky němu může být genom jedné bakterie kombinací genů od několika různých dárců.  V tomto případě použili vědci algoritmus k analýze sbírky 616 kompletních genomů bakterie Streptococcus pneumoniae, která je významným lidským patogenem. Způsobuje celou řadu typů pneumokokových infekcí, jako je pneumonie, zánět středního ucha, bakteriální meningitida a další.

Studie identifikovala několik jednotlivých genů, u kterých jsou genové přenosy obzvláště časté. Jsou mezi nimi i geny, které u bakterií způsobují rezistenci na antibiotika. „V případě genů pro rezistenci vůči antibiotikům, může počet přenosů genetických informací souviset s tím, jak jsou tyto geny pro bakterie užitečné, a s výsledným selekčním tlakem,“ říká výzkumný pracovník Pekka Marttinen z fakulty informatiky univerzity Aalto.

Vědci prokázali, že se přenos genetické informace objevuje, jak v rámci jednoho druhu, tak i mezi několika různými druhy. Velký počet přenosů zjištěných během studie byl přitom pro výzkumníky překvapením. „Předchozí studie ukázaly, že jsou přenosy genetické informace běžné u jednotlivých genů. Náš tým byl však první, který použil výpočetní metodu, aby ukázal rozsah přenosů napříč celým genomem,“ dodává Marttinen.

Publikováno:
Další články autora
Právě v prodeji
Tip redakce

Související články

Města: Pekelné díry, nebo místa k životu?

Města: Pekelné díry, nebo místa k...

Jsou současná města ještě místem pro kvalitní život? Inu, jak která. Nicméně je...
Porazíme kůrovce elektrickým proudem?

Porazíme kůrovce elektrickým...

Protože se nám destruktivní činnost kůrovce stále nedaří zastavit...
Jak chytré telefony mění lidské mozky…

Jak chytré telefony mění lidské...

Tlačítkové telefony sice ještě nepatří na smetiště dějin, avšak jejich...
Pivaři nebudou strádat: Nový gen zajistí dostatek ječmene

Pivaři nebudou strádat: Nový gen...

Vědci ze skotské Heriot-Wattovy univerzity po pěti letech izolovali gen...
Zelenina na Marsu? Na České zemědělské univerzitě probíhá unikátní projekt Marsonaut

Zelenina na Marsu? Na České...

Na České zemědělské univerzitě (ČZU) v pražském Suchdole vznikla ojedinělá...
Na řidiče příliš hlučných vozidel si ve Francii došlápne speciální radar

Na řidiče příliš hlučných vozidel si...

Příliš hlučné automobily a motocykly představují velký problém na mnoha místech...
Jak budeme komunikovat s umělou inteligencí budoucnosti? Podle Muska složitě

Jak budeme komunikovat s umělou...

Když byl populární podnikatel, vynálezce, inženýr a filantrop Elon Musk před...
Baterie budoucnosti? Jen tak se nepoškodí a udrží si svou kapacitu

Baterie budoucnosti? Jen tak se...

Odborníci z univerzity v Canterbury usilovně pracují na pokročilém typu baterie,...
Svět se bude potýkat se zbraněmi, které zabijí jen konkrétní skupinu lidí

Svět se bude potýkat se zbraněmi,...

Představme si na chvíli biologickou zbraň, která by dokázala...
E-cigarety škodí krevnímu oběhu

E-cigarety škodí krevnímu oběhu

Jak moc člověku škodí klasické cigarety víme už dávno. Ale co ty...

Nenechte si ujít další zajímavé články

Poznejte historii a kulturu kazašské stepi

Poznejte historii a kulturu...

Zajímáte se o kazašskou historii a kulturu a rádi byste se o ní dozvěděli...
Modelína: Z čistidla tapet hračkou století?

Modelína: Z čistidla tapet...

Má zářivé barvy, umělou vůni a tisíce měnících se podob. A...
Vraždy za doživotí: Co v Čechách způsobil Kevin Dahlgren?

Vraždy za doživotí: Co v Čechách...

Kevin Dahlgren byl občan USA, který měl v Čechách příbuzné....
Chřipka ani pneumokokové infekce prý nejsou nachlazení

Chřipka ani pneumokokové infekce...

Proměnlivé počasí podzimních a zimních měsíců přispívá ke zvýšenému výskytu...
Co by se stalo, kdybychom celý život strávili ve tmě?

Co by se stalo, kdybychom celý...

Možná jste si už pomysleli, jak deprimující by to bylo. V Indonésii lidé...
Cesta k ekonomickému krachu impéria: Řím doplácel na nenasytnou armádu

Cesta k ekonomickému krachu impéria:...

Historikové dnes uvádějí řadu příčin zániku starověkého římského impéria. Vpád...
Se smrtelnou nemocí bojují tisíce lidí

Se smrtelnou nemocí bojují tisíce...

Jako chůze po zmrzlém sněhu nebo rozepínání suchého zipu – tak zní při...
Děti, které přežily nemožné

Děti, které přežily nemožné

Děti na rozdíl od dospělých mají úžasně odolné tělo. Jen si vzpomeňte, co...
Emancipace ve Starém Egyptě: Něžné pohlaví postaví do latě houf mužských úředníků

Emancipace ve Starém Egyptě: Něžné...

„Kdosi se nicméně pokusil mne o tuto půdu připravit, a já jej budu za...
Poznejte své IQ

Poznejte své IQ

V našem profesionálně sestaveném testu ihned zjistíte přesné výsledky a obdržíte certifikát.