Algoritmus ukázal přenos genů mezi odlišnými druhy bakterií

Streptococcus pneumoniaeVědci z finské univerzity Aalto zkombinovali strojové učení a bioinformatiku, aby vytvořili nový počítačový algoritmus. Jeho úkolem je modelovat přenosy genů nejen mezi různými rodovými liniemi bakteriální populace, ale dokonce mezi různými druhy.

Bakterie si předávají genetický materiál v procesu nazvaném horizontální přenos genetické informace. Díky němu může být genom jedné bakterie kombinací genů od několika různých dárců. V tomto případě použili vědci algoritmus k analýze sbírky 616 kompletních genomů bakterie Streptococcus pneumoniae, která je významným lidským patogenem.

Způsobuje celou řadu typů pneumokokových infekcí, jako je pneumonie, zánět středního ucha, bakteriální meningitida a další.

Studie identifikovala několik jednotlivých genů, u kterých jsou genové přenosy obzvláště časté. Jsou mezi nimi i geny, které u bakterií způsobují rezistenci na antibiotika. „V případě genů pro rezistenci vůči antibiotikům, může počet přenosů genetických informací souviset s tím, jak jsou tyto geny pro bakterie užitečné, a s výsledným selekčním tlakem,“ říká výzkumný pracovník Pekka Marttinen z fakulty informatiky univerzity Aalto.

Vědci prokázali, že se přenos genetické informace objevuje, jak v rámci jednoho druhu, tak i mezi několika různými druhy. Velký počet přenosů zjištěných během studie byl přitom pro výzkumníky překvapením.

„Předchozí studie ukázaly, že jsou přenosy genetické informace běžné u jednotlivých genů. Náš tým byl však první, který použil výpočetní metodu, aby ukázal rozsah přenosů napříč celým genomem,“ dodává Marttinen.

Publikováno:
Další články autora
Právě v prodeji
Tip redakce
reklama

Související články

Když tetřívci „pšoukají“

Akustická individualita může hrát v období páření u mnoha ptáků velkou roli....

Ochutnáme jahody a maliny bez virů?

Jaké viry jahodám a malinám škodí? Jakým způsobem je před nimi chránit,...

Nalezen pravděpodobně jeden z...

25 milionů let stará fosilie objevená na vzdálené stanici skotu v...

Unikátní fakta o dětském mikrobiomu

Zdánlivě „přátelské“ bakterie, které žijí přirozeně ve střevech dítěte, mohou ovlivnit...

Genové úpravy opět na scéně

Výzkumníci jsou přesvědčeni, že je biotechnologie srovnatelná s tradičními...

Důmyslné maskování

Je obecně známo, že samičky kolibříků bělokrkých mění po snesení vajec své...

Africké horské lesy zadržují více...

Mezinárodní tým vědců zabývající se studiem tropických horských lesů v Africe...

Zachycena při činu

Vědci nevycházejí z úžasu při pohledu na videozáznam pořízený na Seychelách....

Návrat plejtváků do jejich...

Plejtváky to táhne zpět do jejich původního prostředí, do vod Atlantského...

Trekking – Sport nebo...

Na procházce lesem není nic špatného. Ve skutečnosti mnoho lidí...

Nenechte si ujít další zajímavé články

Lidový svátek: Chtěl císař Josef II. sebrat lidem posvícení?

Lidový svátek: Chtěl císař Josef...

„Vezměte koště a alespoň zameťte, holoto líná,“ napomíná hospodyně...
Analýzy DNA našich předků: Potomci Velkomoravanů žijí mezi námi, slovanské kořeny má jenom třetina Čechů

Analýzy DNA našich předků: Potomci...

Průzkumy DNA, které pátrají po potomcích velkomoravských velmožů i...
Jedno jméno nestačí! Proč máme příjmení?

Jedno jméno nestačí! Proč máme...

Křestních jmen je málo. Abychom se v tom ohromném počtu lidí na Zemi...
Oslavy tradičního svátku: Prozradily svatého Martina husy?

Oslavy tradičního svátku:...

Muž v jednoduché mnišské kutně vleze do hospodářského stavení plného opeřenců. „Snad mne...
Pyrit, zlato hlupáků: Naletí mu i anglická královna!

Pyrit, zlato hlupáků: Naletí mu i...

Není všechno zlato, co se třpytí. Ví to i anglický cestovatel...
Otec kolečkových bruslí si na nich utrhl ostudu

Otec kolečkových bruslí si na...

„Je vyšší, než obvykle,“ podivují se hosté na maškarním plese, když se tu...
Kníže Spytihněv II. udělal ze svého bratra sluhu

Kníže Spytihněv II. udělal ze...

Komora, stáj, stůl a číše tvoří v 11. století součást života přemyslovské curie, tedy...
Nápoj pro zahřátí: Vikingové se bránili lezavé zimě popíjením obdoby grogu

Nápoj pro zahřátí: Vikingové se...

„Je mi zima, “ drkotá zuby mladý Viking Erik. „Napij se, nápoj bohů tě...
Auto s pásy a lyžemi. Ruský car nejspíš vlastnil první terénní vůz na světě

Auto s pásy a lyžemi. Ruský car...

Kodrcání na koňském hřbetu patří do staré doby. Cara Mikuláše II. jeho poddaní...
Poznejte své IQ

Poznejte své IQ

V našem profesionálně sestaveném testu ihned zjistíte přesné výsledky a obdržíte certifikát.