Algoritmus ukázal přenos genů mezi odlišnými druhy bakterií

Streptococcus pneumoniaeVědci z finské univerzity Aalto zkombinovali strojové učení a bioinformatiku, aby vytvořili nový počítačový algoritmus. Jeho úkolem je modelovat přenosy genů nejen mezi různými rodovými liniemi bakteriální populace, ale dokonce mezi různými druhy.

Bakterie si předávají genetický materiál v procesu nazvaném horizontální přenos genetické informace. Díky němu může být genom jedné bakterie kombinací genů od několika různých dárců.  V tomto případě použili vědci algoritmus k analýze sbírky 616 kompletních genomů bakterie Streptococcus pneumoniae, která je významným lidským patogenem. Způsobuje celou řadu typů pneumokokových infekcí, jako je pneumonie, zánět středního ucha, bakteriální meningitida a další.

Studie identifikovala několik jednotlivých genů, u kterých jsou genové přenosy obzvláště časté. Jsou mezi nimi i geny, které u bakterií způsobují rezistenci na antibiotika. „V případě genů pro rezistenci vůči antibiotikům, může počet přenosů genetických informací souviset s tím, jak jsou tyto geny pro bakterie užitečné, a s výsledným selekčním tlakem,“ říká výzkumný pracovník Pekka Marttinen z fakulty informatiky univerzity Aalto.

Vědci prokázali, že se přenos genetické informace objevuje, jak v rámci jednoho druhu, tak i mezi několika různými druhy. Velký počet přenosů zjištěných během studie byl přitom pro výzkumníky překvapením. „Předchozí studie ukázaly, že jsou přenosy genetické informace běžné u jednotlivých genů. Náš tým byl však první, který použil výpočetní metodu, aby ukázal rozsah přenosů napříč celým genomem,“ dodává Marttinen.

Publikováno:
Další články autora
Právě v prodeji
Tip redakce

Související články

Střevní elektrické generátory

Střevní elektrické generátory

V našich střevech byla potvrzena existence bakterií,  které vydávají...
Budoucnost dopravy v městech podle automobilky Mercedes-Benz

Budoucnost dopravy v městech...

Jedna z nejznámějších německých automobilek Mercedes-Benz představila v Kodani...
Dočkáme se revolučního fotoaparátu bez čoček?

Dočkáme se revolučního fotoaparátu...

Technologie v oblasti fotografování pokračují neustále ve vývoji. Dokonce i...
Formule E a revoluční technologie se objevily v Praze

Formule E a revoluční...

Od čtvrtka do dnešního dne probíhá již druhý ročník Future Port Prague...
Již za dva roky bude spuštěna mobilní síť páté generace 5G

Již za dva roky bude spuštěna...

Mobilní sítě procházejí v posledních letech neustálým rozvojem a doslova každým měsícem...
Světově unikátní detektor elektronů pochází z Brna

Světově unikátní detektor...

Tým brněnských vědců vyvinul a patentoval unikátní detektor elektronů pro tzv....
Když vědci sledují život v buňkách

Když vědci sledují život v buňkách

Vědci ze specializovaného metabolomického pracoviště Biologického centra AV ČR v...
Původce černého kašle je mistrem v manipulaci s imunitou. Čeští vědci ukazují proč

Původce černého kašle je mistrem v...

Bakterie způsobující černý kašel, onemocnění dýchací soustavy s potenciálně...
Jak bude vypadat svět “zítra”?

Jak bude vypadat svět...

Odborníci z IBM každoročně přicházejí s technologickou předpovědí nazvanou “5...
Nemoc X: Velká neznámá, která může ohrozit lidstvo

Nemoc X: Velká neznámá, která...

Její nebezpečnosti by se mohla rovnat snad jen její neznámost....

Nenechte si ujít další zajímavé články

Amazonský prales skrývá neznámé kultury!

Amazonský prales skrývá neznámé...

Od počátku epochy objevitelských cest uplynulo přes půl tisíciletí. Za tu...
Jaké věci nikdy nesdílejte s ostatními?

Jaké věci nikdy nesdílejte s...

U věcí, které byste nikdy nepůjčili svému kamarádovi,...
Toalety patří už ve starověku mezi výnosný obor podnikání!

Toalety patří už ve starověku mezi...

Jedna z židovských moudrostí říká, že není dobré příliš brzy vstávat ze záchodu....
Obrazem: Když se zvířata promění v komiky

Obrazem: Když se zvířata promění...

Fotografická soutěž Comedy Wildlife Photography Awards každoročně přináší...
5 nejšílenějších jídel asijské kuchyně

5 nejšílenějších jídel asijské...

Zatímco v Číně právě probíhá festival psího a kočičího masa, proti kterému...
VIDEO: Lidé se zvláštní barvou pleti

VIDEO: Lidé se zvláštní barvou...

Kožními problémy trpí poměrně velká část lidí. Ať už se jedná...
K uchování hudby lidem sloužily ďábelské vynálezy i preparovaný krk zpěváka

K uchování hudby lidem sloužily...

Ačkoli je to neuvěřitelné, už v 9. století lidem nestačí živá hudba. Proto se...
Slon: Majestátní vládce savan!

Slon: Majestátní vládce savan!

Je to největší suchozemský savec a v lidech úctu vzbuzuje už odpradávna....
Jsou blondýnky atraktivnější než brunety?

Jsou blondýnky atraktivnější než...

Blondýny budí u mužů pozornost, kamkoliv přijdou. A bylo tomu tak...
Poznejte své IQ

Poznejte své IQ

V našem profesionálně sestaveném testu ihned zjistíte přesné výsledky a obdržíte certifikát.