Genetický kód chobotnice obsahuje přibližně 2,7 miliardy genetických písmen, což podobné jako u lidského genomu, který má zhruba tři miliardy písmen. Pro srovnání první přečtený genom, který patří bakterii Haemophilus influenzae, obsahuje pouze 1 830 140 párů bází DNA.
Přečtený genetický kód chobotnice potvrdil i jejich vysokou inteligenci. DNA řídící vývoj mozku a nervového systému je u chobotnic proti jiným živočichům neobvykle rozvinutá. Velké množství úseků DNA chobotnic je rovněž specifické pouze pro ně.
Vědci se domnívají, že právě tyto úseky mohou za jejich schopnost měnit barvu, přísavky na spodní straně chapadel, nebo dokonalý zrak.
Naopak nebyly nalezeny žádné stopy po zdvojení genomu v počátcích vývoje chobotnic. U obratlovců se přitom genom v průběhu historie zdvojil hned dvakrát.