Fleming již v roce 1922, šest let před objevem penicilinu, předběhl dobu s dalším převratným nálezem enzymu jménem lysozym. Ten se běžně vyskytuje např. ve slinách, slzách, nosním hlenu či v krevní plazmě. Když vědec dostal rýmu, umístil vlastní hlen do misky s koloniemi mikroorganismů a zjistil, že tento enzym vykazuje silné antibakteriální vlastnosti.
Alexander Fleming zemřel v březnu 1955 v Londýně ve věku 73 let.