Na počest Keplerových objevů bylo po něm v Praze pojmenováno gymnázium, nacházející se v místě, kde Kepler pobýval. Má také kráter na Měsíci a na Marsu a hřeben na jeho měsíci Phobos. Existenci měsíců obíhajících Mars Kepler předpověděl již v roce 1610.